Khoa Ngoại tổng hợp của Trung Tâm Y Tế Huyện Phú Tân là khoa chuyên sâu, chuyên điều trị các bệnh lý về đường tiêu hóa, và Gan - Mật - Tụy. Cùng với hệ thống máy móc và trang thiết bị hiện đại của bệnh viện, Khoa Ngoại tổng quát: Gan - Mật - Tụy thực hiện khám, tư vấn, chẩn đoán và điều trị, trong đó có cả phẫu thuật và can thiệp nội soi.
